Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ClpbQ60649 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ClpbQ60649 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms