Protein–RNA interactions for Protein: Q60519

Sema5b, Semaphorin-5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5bQ60519 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sema5bQ60519 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sema5bQ60519 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms