Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tsr1Q5SWD9 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsr1Q5SWD9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms