Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LpoQ5SW46 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LpoQ5SW46 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms