Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ggnbp2Q5SV77 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ggnbp2Q5SV77 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms