Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bbs12Q5SUD9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms