Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TefmQ5SSK3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TefmQ5SSK3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms