Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Utp18Q5SSI6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms