Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rnf215Q5SPX3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms