Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms