Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Smg7Q5RJH6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Smg7Q5RJH6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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