Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rtp3Q5QGU6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms