Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CoblQ5NBX1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms