Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SynaQ5G5D5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms