Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lrrc8bQ5DU41 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms