Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fam208bQ5DTT3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fam208bQ5DTT3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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