Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR3

Prune2, Protein prune homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune2Q52KR3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Prune2Q52KR3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Prune2Q52KR3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms