Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Otol1Q4ZJM7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms