Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms