Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rhox3aQ4TU90 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3aQ4TU90 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms