Protein–RNA interactions for Protein: Q3V209

Tmub2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmub2Q3V209 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmub2Q3V209 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmub2Q3V209 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms