Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ckap2Q3V1H1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ckap2Q3V1H1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ckap2Q3V1H1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms