Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Dnah12Q3V0Q1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Dnah12Q3V0Q1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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Dnah12Q3V0Q1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Dnah12Q3V0Q1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
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Dnah12Q3V0Q1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Dnah12Q3V0Q1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Dnah12Q3V0Q1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms