Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ttc9Q3V038 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ttc9Q3V038 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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