Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnpc3Q3UZ01 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rnpc3Q3UZ01 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rnpc3Q3UZ01 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rnpc3Q3UZ01 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms