Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kdm5aQ3UXZ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kdm5aQ3UXZ9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms