Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E330034G19RikQ3UWX6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
E330034G19RikQ3UWX6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms