Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Clca4bQ3UW98 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca4bQ3UW98 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca4bQ3UW98 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca4bQ3UW98 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca4bQ3UW98 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca4bQ3UW98 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca4bQ3UW98 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca4bQ3UW98 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Clca4bQ3UW98 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms