Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm12888Q3UW77 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm12888Q3UW77 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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