Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slfn4Q3UV66 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn4Q3UV66 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms