Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Obox3Q3UT54 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Obox3Q3UT54 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms