Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Syndig1lQ3USQ7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Syndig1lQ3USQ7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms