Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Acsf3Q3URE1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Acsf3Q3URE1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms