Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog7Q3UM29 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cog7Q3UM29 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms