Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CrxosQ3UL53 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CrxosQ3UL53 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms