Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp19Q3UJD6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp19Q3UJD6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms