Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnep1r1Q3UJ81 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cnep1r1Q3UJ81 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms