Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Dtx3lQ3UIR3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Dtx3lQ3UIR3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms