Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft2Q3UF64 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms