Protein–RNA interactions for Protein: Q3UE31

Uncharacterized protein KIAA0930 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UE31 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q3UE31 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q3UE31 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q3UE31 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UE31 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UE31 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UE31 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UE31 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UE31 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UE31 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Q3UE31 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q3UE31 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q3UE31 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UE31 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UE31 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UE31 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q3UE31 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms