Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ssbp4Q3U4B1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ssbp4Q3U4B1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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