Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gse1Q3U3C9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gse1Q3U3C9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms