Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Kdm4dQ3U2K5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Kdm4dQ3U2K5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Kdm4dQ3U2K5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Kdm4dQ3U2K5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Kdm4dQ3U2K5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Kdm4dQ3U2K5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms