Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tamm41Q3TUH1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tamm41Q3TUH1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms