Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Calr4Q3TQS0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Calr4Q3TQS0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms