Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Smarca4Q3TKT4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Smarca4Q3TKT4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Smarca4Q3TKT4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Smarca4Q3TKT4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms