Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp39Q3TIX9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Usp39Q3TIX9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms