Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYK4

Vrtn, Vertnin, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VrtnQ3SYK4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VrtnQ3SYK4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VrtnQ3SYK4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms