Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rspo3Q2TJ95 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms