Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Teddm2Q208S0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Teddm2Q208S0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms